কাস্টমস্, এক্সাইজ ও ভ্যাট, ঢাকা (দক্ষিণ) কমিশনারেট জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের অধীন একটি অন্যতম শুল্ক, আবগারী ও মূল্য সংযোজন কর কমিশনারেট। ১৯৯১ সনে প্রবর্তিত মূল্য সংযোজন কর ব্যবস্থায় পরোক্ষ করের আওতা সম্প্রসারিত হওয়ায় মাঠ পর্যায়ে রাজস্ব প্রশাসনের গতিশীলতা বৃদ্ধির লক্ষ্যে ১৯৯৩ সনের ১লা জুলাই কাস্টমস্, এক্সাইজ ও ভ্যাট, ঢাকা (দক্ষিণ) কমিশনারেট এর কার্যক্রম শুরু হয়। এ দপ্তরের অধীন ৮টি বিভাগীয় দপ্তর,  ২৮ টি সার্কেল অফিস এবং ০১ টি এলসি স্টেশন শুল্ক, আবগারি ও  মূল্য সংযোজন কর আহরণে নিয়োজিত ছিল। ২০১২ সালে জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের আওতাধীন দপ্তরসমূহ পুনঃগঠনের ফলে বর্তমানে কাস্টমস্, এক্সাইজ ও ভ্যাট কমিশনারেটের, ঢাকা (দক্ষিণ), ঢাকার আওতাধীন ০৮টি বিভাগ ও ৩২টি সার্কেল অফিস রাজস্ব  আহরণে নিয়োজিত রয়েছে।